Se realizó el análisis de amenazas naturales por inestabilidad de laderas, inundaciones, ocurrencia de flujos piroclásticos y lahares, con el propósito de cuantificar el impacto que estos fenómenos tienen sobre las más de 300,000 personas que habitan la región. La dinámica geohidrológica de la cuenca del Río Samalá (de 1,500 km2) y del complejo volcánico Santa María-Santiaguito provoca la ocurrencia periódica de oleadas y flujos piroclásticos, lahares e inundaciones repentinas (flash floods) que afectan la infraestructura básica (Carretera Panamericana y Puente “Castillo Armas”), centros poblados (principalmente San Felipe, San Sebastián y Retalhuleu) y, en general, la actividad agrícola y ganadera de la región.

Para la determinación de las planicies de inundación del rio Samalá se utilizó el método clásico de cálculo de caudales máximos a partir del procesamiento de series de datos históficos para períodos de 100, 50, 25 y 10 años del propio río o cuencas vecinas. Los caudales se utilizaron para un modelado espacial por medio del programa HEC-RAS. Se logró determinar que las crecidas máximas del rio Samalá no afectan directamente a San Sebastián, pero pueden provocar enormes daños a la Carretera Panamericana.